大陸繼對陸客赴台自由行喊卡之後，8月5日傳出還將要全面停航小三通旅遊，不過涉台權威人士出面否認此一消息，向多位福建省台港澳辦官員查證，也表示沒有聽到相關的消息。而有大陸涉台人士指出，在中共總書記習近平提出福建省要與金門、馬祖的「新四通」之際，對於金門、馬祖必然要加強融合發展，就算取消自由行，也不會擴及金馬。
在8月1日陸客來台自由行暫停之後，過去陸客要從金門、馬祖中轉到台灣本島，也一同被暫停，但這跟暫停小三通金馬自由行卻是兩回事。9月1日起團客部分將禁止經由小三通管道來台，每天約影響300到400人。
有媒體報導，傳出大陸將全面停航小三通，旅行公會理事長蕭博仁也表示有得到消息指稱，預計從9月1日起就會停航。不過涉台權威人士5日面對詢問，嚴正否認此消息。
當者向多位的福建省台港澳辦官員詢問，有的說「沒聽說」，有的表示「目前沒有接到相關消息」，還有位官員批評說，這是台灣方面故意放出的假消息，想要製造恐慌。
一位北京涉台人士指出，習近平今年初才提出要針對福建與金馬實施「新四通」，對金馬通水通電通氣通橋，要把福建建為台胞登陸的第一家園，5日也剛好是新四通一周年，金馬對北京具有特殊的「試點」定位，因此沒有理由將僅限於福建與金馬澎的小三通自由行取消。
某位金門縣政府前官員表示沒聽說這件事，他還特別指出，金馬澎的自由行，與大三通的自由行是脫鉤的，不過在8月1日自由行暫停後，過去陸客要從金門馬祖中轉到台灣本島，則已被暫停，但他強調，那屬於大三通的自由行被禁，不算是小三通被擋。
根據業內人士介紹，陸客若要赴台自由行，先要辦理大陸發放的大陸居民往來台灣通行證（大通證），有效期為10年，接著辦理期限為6個月的自由行簽證，即為「G簽」，接著再辦理台灣發放的入台證，有效期為3個月，目前大陸取消的是G簽。
陸委會5日表示，有關媒體報導陸方將自9月起全面停止陸客透過「小三通」來台金、馬、澎旅遊以及「小三通」停航等事，經陸委會透過航運及旅遊多元管道瞭解，均無此訊息，應是媒體誤傳。